与前作女主角优莱卡一样拥有一头青色头发的男主角是一名13岁少年，名字叫做弗卡依 青，目前弗卡依的父亲行踪不明，而母亲也在10年前不知被谁带走了。现在正与诊疗所里的老医生托斯奥一同生活。而女主角阿拉塔 娜露同样也是13岁，是与弗卡依一同成长的青梅竹马，阿拉塔因为童年时的事故而使拥有“犹达”力量的眼睛觉醒。阿拉塔自少身体便虚弱，需要把酸素放入在手上的酸素吸入器，现与父亲、妹妹及祖母一同生活中。本作的舞台也设定在冲绳的磐户岛上，当时的磐户岛正进行着自治权回复运动，但在某一天，在岛上出现的“珊瑚岩”受到了外界的攻击，而为了保护磐户岛，男主角弗卡依与人型LFO（Light Finding Operation）相遇的故事就此展开了。